تحقیقات علمی نشان داده که مصرف گلوتن در فرد مبتلا به سلیاک سطح آنتی بادیهای خاصی که توسط سیستم ایمنی فرد ساخته شده، افزایش مییابد که باعث ایجاد یک واکنش التهابی در روده کوچک میشود که نتیجه آن تخریب پرزهای روده کوچک است. به همین دلیل است که سلیاک را خودایمن یا اتو ایمیون میگویند چون سیستم ایمنی فرد با پاسخ نادرست مسبب التهابات در سیستم گوارشی است. سلیاک با انجام یکسری آزمایشات سرولوژی (آزمایش خون) و آندوسکپی و نمونه برداری از روده کوچک (بیوپسی) و آسیبشناسی نمونه برداشته شده تشخیص داده میشود .
شناسایی سلیاک امر پیچیدهای است و باید توسط پزشکان ( کبد و گوارش اطفال و یا بالغین ) تشخیص داده شود، گاهی بعضی افراد به غلط و صرفا با داشتن چند علامت، بدون مشورت با پزشک متخصص خودسرانه رژیم فاقد گلوتن را بطور ناقص آغازمی کنند که با این عمل تشخیص واقعی را به تاخیر میاندازد و هر قدر زمان تشخیص طولانیتر باشد شروع درمان دیرتر و عوارض سوء جذب بیشتر خواهد شد.